人工湿地末端比较常见的是生态塘。生态塘是利用原有的池塘生态结构，经过人工强化措施（如种植水生动植物和增氧等）对氮和磷等营养盐进行高效吸附和降解，使出水符合污水排放标准。将生态塘与人工湿地组合，除了可以进一步削减污染物之外，两者工艺在生态景观上具有很高的融合性。段田莉等研究了高效垂直流人工湿地和生态塘的组合工艺对900m3/d的污水厂尾水深度净化的效果，结果表明，人工湿地末端的多级生态塘强化了氨氮和总氮的去除效果，降低了受纳水体的富营养化风险。
此外，由于人工湿地对于粪大肠菌群等的去除能力有限，在人工湿地出水之后会加上消毒工艺，以保证微生物类指标能够达到排放标准。Nunziatina等研究了人工湿地结合UV消毒技术，以去除肠道病原体和废水中的污染物。人工湿地平均可以去除66%的COD和3.1个对数单位的粪大肠菌群，最终的出水符合灌溉标准。
总体而言，人工湿地与其他废水处理工艺的组合或整合实现了“双赢”的表现，并为人工湿地的广泛应用提供了新的途径。人工湿地组合工艺技术能有效的削减污染物负荷，提高出水水质，同时有利于构建起融入城市环境景观的污水处理系统。但是，组合工艺也存在工艺冗长和占地面积过大的问题。因此，需要重点研发人工湿地内部组合的工艺技术。而针对CW-MFC系统的研究上，国内外的研究主要集中在产电性能优化、常规有机物和氮的去除研究上，而对新兴污染物尤其是难降解的特定污染物（抗生素和抗性基因等）的协同高效处理的研究还很少。此外，还需要进一步的研究和改进人工湿地组合工艺的方法和模式，以提出针对特定污水的最佳组合工艺技术，充分发挥人工湿地在水质净化上的优势。
