由于天然沸石的特殊特性，因此成为（工业/废物/井/土壤/农业/牲畜）水处理的过滤介质。就其特性来说，沸石特别适用于软化装置、除铁和去除废水中的铵、硝酸盐和锰。也广泛用于养鱼场。
试验结果以 300 mg N-NH4/升的浓度从废水中去除 >99% 的铵。这种情况下的去除能力为每克沸石 90 毫克铵。
脱铁和脱锰高达 17 毫克/升。已知铁去除结果从17 毫克铁/升到 0.015 毫克/升。一般来说，铁含量应小于0.2mg/l。
在水软化装置中，沸石用作离子交换剂，将水中的钙（石灰）和镁与沸石中的钠和钾进行交换。
沸石还用于洗涤剂中作为软化水的离子交换剂，增加中度酸性水 (>5) 的 pH 值。这是因为酸性氢离子 (H+) 被吸收到晶体中。
由于沸石的吸收能力，氨/铵可从废水、井水或饮用水等中提取。沸石用作过滤介质以去除氮、有机碳氢化合物和有毒阳离子，如铁、锰、甲烷、银、汞、铜、镍、铬、钴、铅、锌和砷。
实际示例：2000 微克锌/升水，流速为 1 立方米/小时，减少到 400 微克锌/升水。沸石吸收亚硝酸盐和硝酸盐的能力无与伦比，可显著抑制地表水、园艺盆、池塘、游泳池等中（蓝色）藻类的生长。
沸石的更多应用：
清洁垃圾填埋场和有机废物处理设施的渗滤液。
来自污水、冶炼、纸浆和造纸厂的下游水的富氧。
沸石用于从铜精炼中回收银以及从精炼废物中去除铅和镉。
沸石用于从受污染的核反应堆冷却水中去除锶和铯的放射性同位素。
总之，使用沸石进行过滤有益于环境，使鱼类更健康，并防止有毒蓝藻（蓝藻）的强烈生长。
