沸石作为新型环保材料，能够有效对水体进行污染去除处理。​伴随着养殖业的发展，饲养规模在接连不断扩大，其所带来的环境问题已日趋严重。饲料中大量的磷和氮不可以被畜禽有效利用而排出体外，导致污水中附有高浓度氮和磷，使水体富营养化，而且污染严重。

何洁等研究表示，沸石作为载体，附着其上生物膜的氨化效果和亚硝化效果好于活性炭和沙子。且进一步指出沸石的经济成本低，以沸石为载体对养殖废水有足够的处理能力，适合国内外大多数集约化养殖生产，所以在养殖废水处理中有着广泛的应用前途。

利用沸石的离子交换性质等，可有效地去除水中的重金属离子。美国研究团队证实沸石（尤其是以斜发沸石为主），其对 Pb和其他的重金属起到很强的亲和力，对 Pb的吸附能力多在 155.4mg/g左右，因此在投入到污水处理中具有良好的吸附效果。

还可以用酸、氧化剂、复原剂、金属盐等对沸石进行改性，来进一步改善其吸附功能。Li等人发现经阳离子外表活性剂改性的沸石，其在保持原有功能基础之上，还可去除水中的含氧酸阴离子，并大大提高了其去除无机物的功效。

丁锐等以为以煤等廉价的含碳原料或/和氧化镁等，与天然沸石复合加工制备吸附材料，其孔径大，成本较低，更适用于去除水中无机物。研究人员通过分析试验，发现沸石可以在PH5-10范围内，吸附渗滤液中的氟、铬和铅等有害离子，因此除了传统废水处理领域中，其也可以应用于垃圾处理的渗液处理，具有良好的经济效益和市场前景。