植物是影响人工湿地净化水体效能的关键因素之一，其可直接吸收利用水体中的营养物质促进自身生长，同时达到净化水体的效果；植物根系为水体微生物提供良好的栖息场所，同时还可进行输氧、泌氧从而创造好氧、厌氧的根际微环境。除此之外，植物在改善区域气候，促进生态环境的良性循环，塑造良好景观效果等方面发挥着不可替代的作用。
用于净化水体的湿地植物类型丰富，对水体净化机理也十分复杂，在考虑选择人工湿地植物时，除了考虑植物本身对水体净化的效能，还应考虑植物本身生长繁殖特性是否与湿地环境协调，从而维持湿地生态系统的稳定性。因此，科学、合理地选用湿地植物，是人工湿地系统建设与应用及维护的重要环节，在未来研究中，也是我们需要进行深入探索的重要课题。
未来，加强对湿地植物与湿地微生物的耦合作用，达到协同去除水体污染物的目的。水体污染物的去除主要是通过植物本身吸收、吸附和富集等以及根系微生物反应来共同完成的。研究表明，即使在大型水生植物大量存在的人工湿地中，微生物代谢作用净化水体仍占主要地位。
